自我介绍

你好，我是一树，来自首都师范大学生命科学学院，目前就读专业为生物科学（非师范），本科生，我对后端开发和云原生充满兴趣，现在在做一些生物信息学相关的科研训练，我们实验室主要研究方向是鳞翅目昆虫

教育经历

• 2023年9月 - 2024年6月 首都师范大学物理系 光电信息科学与工程
• 2024年9月 - 至今 首都师范大学生命科学学院 生物科学

实验室经历

首都师范大学生命科学学院遗传与进化多样性实验室

时间：2025年9月 - 至今

以科研实训身份加入实验室，参与高通量分子对接和 iLepBase 鳞翅目数据库建设等项目，主要工作包括数据清洗、流程搭建、数据库相关开发，以及生物信息学工具链的学习和实践

技能

熟练掌握 Claude Code 和 Codex 等工具的安装和卸载，以及模型配置，下面的技术栈可以忽略（狗头）

• 编程语言：Python、JS/TS、Go、C、Rust
• 数据库：MongoDB、SQL
• 框架：Gin、Node.Js、PyTorch、LangChain
• 操作系统：macOS、Windows、Ubuntu/Debian
• 摄影：Capture One
• DevOps：Git、GitHub Actions、Docker、Docker Compose、Kubernetes、Postman/ApiFox
• Web：Caddy、Nginx
• Cloud：Cloudflare、Azure、AWS
• Pipeline：Snakemake、Nextflow

项目经历

2025 - 中国科学院软件所开源之夏

时间：2025年6月 - 至今

作为核心开发者参与到小X宝社区的建设和开发当中，我们帮助癌症病人和家属构建了一系列的工具，包括并发症管理、文献查询MCP、指南查询等等功能，欢迎大家了解我们社区，打一个小广告，对于医疗/AI/Agent感兴趣的同学欢迎和我联系，也欢迎通过 GitHub 来了解我们社区和我们现在在做的一些工作：小X宝社区 | GitHub

2025 - SmartDock

时间：2025年9月 - 2026年2月

SmartDock 是一个基于 Nextflow 和 Uni-Dock 的分子对接项目，项目搭建了一套高通量的蛋白结构预测（基于ColabFold）与分子对接 Pipeline，完成了 7000 多个蛋白质从肽链到结构的预测，并进一步支持了亿级小分子次生代谢物与蛋白质之间的对接任务

2026 - iLepBase

时间：2026年1月 - 2026年5月

鳞翅目昆虫数据库项目，主要参考前后端的搭建，前期参与了鳞翅目数据的清洗和整理，后端架构基于Go fiber，可以关注这个组织，我们开源了一些工具：iLepBase | GitHub

开源项目

PubMed MCP Server

为 LLM Agent 提供结构化 PubMed 文献数据的 MCP 服务器，目前在魔搭社区已经有400万次调用，欢迎使用：PubMed文献抓取 | ModelScope

爱好

对科幻、策略和废萌充满兴趣

联系方式

我的电子邮件是：yishu.liu@cnu.edu.cn、liueic@ciallo.cv

你也可以从 GitHub 主页找到我：liueic (Liueic) · GitHub

版权

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