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无能的学生邪修大全

溶液pH与等电点pI比较

人性贪婪法(把 H+ 当钱看) 把溶液里的氢离子(H+)想象成「钱」

pH < pI(数值小): ◦ pH 值越,代表环境里的 H+(钱)越(酸性强)。 ◦ 环境里钱多得溢出来了,蛋白质为了平衡,就会贪污(抢夺)环境里的钱(H+)。 ◦ 抢到了钱(H+),身价自然就变「正」了 带正电pH > pI(数值大): ◦ pH 值越,代表环境里的 H+(钱)越(碱性强) ◦ 环境里太穷了,开始向蛋白质征税,把蛋白质身上的钱(H+)抢走 ◦ 钱被抢走了,身价就变「负」了 带负电。

波长一锅端

A. 280 nm(紫外吸收法): • 这是蛋白质里的芳香族氨基酸(色氨酸、酪氨酸)自带的紫外吸收峰。 • 记忆: 280 是个很整的数字,代表蛋白质的“裸体”本色,不需要任何染料,直接测。

B. 540 nm(双缩脲法): • 这是双缩脲反应(肽键 + 铜离子 紫红色)的吸收峰 • 记忆: 540 我是零(双缩脲法灵敏度比较低,接近于0...虽然夸张了点,但它确实不如BCA和Bradford灵敏)

C. 595 nm(Bradford法/考马斯亮蓝法):正解。 染料与蛋白质结合后,最大吸收峰从 465 nm 移到 595 nm。

D. 650 nm: • 这个波长通常不作为主要考点,有时 Lowry法(Folin-酚试剂法) 会在 750 nm 或 660 nm 附近测定。

蛋白质分子量计算

蛋白质分子量氨基酸数量×110

rRNA的大小亚基

邪修心法第一式:奇偶大对决(357 vs 468)

这是最核心的口诀,记住了这个,框架就搭起来了。

  • 原核生物(Prokaryotes) = 奇数阵营 (3, 5, 7)
    • 数字全看十位数
    • 30S(小) + 50S(大) = 70S(总)
    • 口诀: 原核比较原始,只有“单”枪匹马(奇数 3、5、7)。
  • 真核生物(Eukaryotes) = 偶数阵营 (4, 6, 8)
    • 数字全看十位数
    • 40S(小) + 60S(大) = 80S(总)
    • 口诀: 真核比较高级,讲究成双成对(偶数 4、6、8)。

(注:生物学里的加法不是直接相加,30+50=70是因为沉降系数涉及形状,不是单纯重量,但这不重要,记住口诀就行)


邪修心法第二式:内部拆解(如何记rRNA)

框架搭好了,现在填里面的肉(rRNA)。

1. 小亚基里的rRNA:未成年 vs 成年

  • 原核(小 30S) -> 16S
    • 记忆法: 原核生物比较低级,还是“未成年”,所以是 16 岁(16S)。
  • 真核(小 40S) -> 18S
    • 记忆法: 真核生物进化完全了,是个“成年人”,所以是 18 岁(18S)。

2. 大亚基里的rRNA:数字游戏

这里有个公约数:5S。不管原核还是真核,大亚基里都有一个 5S(可以理解为这是出厂标配,不用记)。

剩下的那个难记的数字怎么办?

  • 原核(大 50S) -> 23S
    • 邪修算法: 看看那个 50S
    • 2 + 3 = 5
    • 所以原核是 23S(对应50S)。
  • 真核(大 60S) -> 5.8S28S
    • 邪修算法: 真核是偶数阵营,所以它不仅多了一个 5.8S,而且最大的那个也是以 8 结尾的 28S
    • 记忆: 真核特别“发”(8),有 5.8 还有 28

总结一张“作弊小纸条” (脑内版)

阵营口诀 (十位)小弟 (小亚基)大哥 (大亚基)备注
原核3、5、7 (奇数)16 (未成年)5 (标配) + 23 (2+3=5)比较穷,rRNA少
真核4、6、8 (偶数)18 (已成年)5 (标配) + 5.8 + 28比较富,rRNA多,都带8

下一步行动:

现在闭上眼,试着回忆一下:“真核是成年人,讲究成双成对”,能不能推出它是 80S (40+60),里面是 18S 和 28S?

ATCase(天冬氨酸转氨甲酰酶)

  • CTP 是“亲儿子”(产物):儿子太多了太吵,老爸(酶)就想罢工(抑制)。
  • ATP 是“隔壁老王”(另一条途径的产物):老王有钱(能量高/ATP多),喊你去干活,你就得去(激活)。

酰胺平面的组成

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羧肽酶

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羧肽酶 B (CP-B) —— “B” for Basic (碱性)

  • 名号含义: 这个 “B” 就是 Basic(碱性)的意思。
  • 猎杀目标: 它专门砍杀 C端 是碱性氨基酸的家伙。
  • 受害者名单:
    • 精氨酸 (Arg)
    • 赖氨酸 (Lys)
    • (这俩都是带正电荷的“硬汉”,也是碱性氨基酸的代表)。

羧肽酶 A (CP-A) —— “A” for Aromatic (芳香) / Aliphatic (疏水)

  • 名号含义: 这个 “A” 代表 Aromatic(芳香族)或者 Avoid Basic(避开碱性)。
  • 猎杀目标: 它喜欢砍 C端 是芳香族(有香味)或者疏水侧链大的氨基酸。
  • 受害者名单:
    • Phe (苯丙)Tyr (酪)Trp (色) —— 芳香族。
    • Leu (亮)Ile (异亮) —— 大疏水基团。
  • 禁忌(它的弱点):绝对不杀碱性氨基酸(Arg, Lys)和脯氨酸(Pro)。

蛋白质水解三巨头

1. 酸水解 (6M HCl, 110℃) —— “最常用的酷刑”

  • 优点: 彻底,干净,不消旋(L型还是L型)。
  • 代价(缺点):
    • Trp (色氨酸)直接灰飞烟灭(被氧化破坏,完全回收率为0)。
    • Asn/Gln:变成了 Asp/Glu(脱酰胺)。
  • 结论: 它是标准流程,但测不到色氨酸。

2. 碱水解 (NaOH/Ba(OH)2) —— “色氨酸的避难所”

  • 优点: 专门为了救 Trp (色氨酸) 而存在的。只有在碱性条件下,色氨酸才能保住小命。
  • 代价(缺点):
    • 这是一招“七伤拳”。虽然救了色氨酸,但会把 Ser (丝), Thr (苏), Cys (半胱) 给弄死。
    • 而且会让氨基酸消旋(全部变成 D/L 混合物,很难分)。
  • 结论: 平时不用,只有专门要测色氨酸的时候,才单独开这一炉。

3. 酶水解 —— “只有做实验(结构分析)才用”

  • 用途: 用于测序(切成大段)、保留立体构型(不消旋)。
  • 分析组分? 绝对不用(因为切不干净 + 自身污染)。

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